在疫情防控期间，企业不执行复工复产疫情防控工作通知和措施的，由卫生行政部门报请政府批准或由卫生行政部门报告政府，由政府依据《传染病防治法实施办法》或《突发公共卫生事件应急条例》作出处理。

 另外，还可直接依据《治安处罚法》第五十条第一项，由公安机构对其负责人予以拘留等处罚。

《传染病防治法实施办法》（卫生部令第17号）

          第七十条　有下列行为之一的单位和个人，县级以上政府卫生行政部门报请同级政府批准，对单位予以通报批评；对主管人员和直接责任人员由所在单位或者上级机关给予行政处分：

　（一）传染病暴发、流行时，妨碍或者拒绝执行政府采取紧急措施的；

　（三）对控制传染病暴发、流行负有责任的部门拒绝执行政府有关控制疫情决定的；

《突发公共卫生事件应急条例》

          第四十八条　县级以上各级人民政府卫生行政主管部门和其他有关部门在突发事件调查、控制、医疗救治工作中玩忽职守、失职、渎职的，由本级人民政府或者上级人民政府有关部门责令改正、通报批评、给予警告；对主要负责人、负有责任的主管人员和其他责任人员依法给予降级、撤职的行政处分；造成传染病传播、流行或者对社会公众健康造成其他严重危害后果的，依法给予开除的行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

         第四十九条　县级以上各级人民政府有关部门拒不履行应急处理职责的，由同级人民政府或者上级人民政府有关部门责令改正、通报批评、给予警告；对主要负责人、负有责任的主管人员和其他责任人员依法给予降级、撤职的行政处分；造成传染病传播、流行或者对社会公众健康造成其他严重危害后果的，依法给予开除的行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

      《治安处罚法》第五十条第一项，有下列行为之一的，处警告或者二百元以下罚款；情节严重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款：  （一）拒不执行人民政府在紧急状态情况下依法发布的决定、命令的；