按照卫生部2012年卫生监督重点检查计划《卫生部办公厅关于印发2012年卫生监督重点检查计划的通知》（卫办监督发〔2012〕30号）要求，重庆市卫生局卫生监督局协助市卫生局制定了《2012年学校卫生重点监督检查计划》，专门召开学校卫生工作会议，部署了该项工作，组织全市各区县卫生监督机构按实施计划规定的内容或时间开展辖区内学校的饮用水、传染病及教学卫生的重点监督检查工作，按时将全市各项重点监督检查情况、总结及汇总资料上报卫生部和市卫生局，并将全市重点监督检查资料归档。
从五月中旬起，全市各级卫生监督局（所）按照《计划》要求，由分管所领导负责，对全市2523所小学、1156所中学、68所高校共计3681所学校进行了包括传染病防控、饮用水安全和教学环境卫生在内的专项重点检查，检查覆盖率达到《计划》要求的100％。
在传染病防控方面：全市的总体合格率达到96%；在配备专业技术人员方面（医护人员和专职保健人员）有所增强，但医务人员配置仍然严重不够，是当前学校存在的突出问题，也是体制带来的不能及时解决的问题。
在饮用水方面，自备水源学校有195所，占到检查学校的8.7%，检查中发现，学校自备供水包括新改扩建项目，绝大多数未经卫生行政部门审查、验收或审查验收不合格，只有8所学校持有卫生行政部门颁发的卫生许可证，仅占检查学校数的2.25%；学校的自备供水设施设备，大多数老旧简陋，基本没有水质净化设施，消毒也多以含氯制剂进行简单消毒，涉水产品和消毒产品多数无卫生许可批件。自备供水学校供管水人员普遍缺乏相应的饮用水卫生安全知识，基本上无水质检测设备。
在教学环境卫生方面，目前教学环境卫生比以前有很大的改观，人均面积合格率达67.5%，桌椅、黑板的合格率分别达到60%和77%。但是，农村小学问题较多。（重庆市卫生局卫生监督局 供稿）