为了规范全省食品安全风险监测工作，保证工作质量，按照国家下发的食品安全风险监测质控方案，结合2011年在全省监测机构开展的质控工作，四川省卫生厅印发了《四川省食品安全风险监测质量控制方案》。在国家方案基础上，四川省质控方案增加了监测机构的日常管理、监测实施计划制定等内容，提出了样品采集阶段、实验室检测阶段、信息报告阶段质量控制的重点内容，明确省疾病预防控制中心对各监测点检出阳性致病菌菌株和污染物检测阳性的特定项目进行复核。《方案》同时要求省疾病预防控制中心根据方案，制定每年度全省食品安全风险监测质量控制实施计划。
《四川省食品安全风险监测质量控制方案》下发后，四川省卫生厅将通过组织人员培训、开展质控考核、进行现场督导等方式督促方案落实，切实提升四川省食品安全风险监测工作质量。