近年来，枣庄市卫生监督所以卫生监督稽查工作为抓手，深入开展内部稽查和层级稽查，积极推进卫生监督工作科学化、规范化、精细化、常态化。
该所高度重视卫生监督稽查工作，所领导亲自抓，配备了数码相机、手提电脑等设备，成立了稽查人员专家库，并实行稽查回避制度；制定完善了《枣庄市卫生监督稽查工作规范》、《卫生行政许可工作标准》、《卫生行政处罚工作规范》、《卫生行政处罚案卷评查标准》、《卫生行政执法责任制》、《错案责任追究办法》和《考核评议制度》等一系列规章制度，明确权责，严格考核，全面落实行政执法责任制；加强对行政处罚、行政许可、举报投诉处理、专项活动及风纪风貌等日常稽查，不断提高卫生监督员素质，规范行政处罚、行政许可及举报投诉处理行为，推动各专项整治活动有序开展；开展层级稽查，对区（市）卫生监督机构卫生行政执法开展稽查，了解各单位工作开展情况，查找存在问题，发现工作亮点，强化业务指导，对发现的问题制作卫生监督稽查笔录，下达卫生监督稽查意见书，将稽查情况进行通报，并将稽查结果与年终考评挂钩，充分发挥了卫生监督稽查工作的规范、指导、督查和评价作用。