2005年6月28日，省卫生监督所召开全所职工大会，会上，酝酿已久的省卫生监督所内设机构调整方案经省卫生厅同意正式实施。内设机构调整是该所先进性教育的重要举措，在6月24日的省卫生监督所先进性教育总结表彰大会上，正式把内设机构调整、加大卫生监督执法力度、提高卫生监督执法水平作为先进性教育落实整改措施的主要内容之一。
29日，新组建的11个处（科）室迅速调整到位，以全新的职能开始运作。此次调整，新成立了综合业务处和监督五处，综合业务处负责全所业务工作的管理和协调，监督五处专司医疗机构监督管理，其他处室的职责也进一步得到了明确。新调整后的11个处（科）室是：办公室（信息处）、人事科、财务科、稽查处、许可受理处、综合业务处、监督一处（食品、学校）、监督二处（化妆品、生活饮用水）、监督三处（传染病、消毒产品）、监督四处（职业、放射）、监督五处（医疗机构）。这次内设机构调整，在全省卫生监督体系建设中具有重要的指导意义，进一步体现了综合执法要求，加强了医疗机构卫生监管，解决了内设机构职责不清、职能交叉等问题。省卫生监督所将以崭新的面貌迎接卫生监督新形势的挑战。