12月27日晚，广东报道发生一例非典疑似病例后，立刻引起了北京市卫生监督所的高度警惕。12月28日下午，市卫生监督所召开紧急会议，贯彻卫生部当天上午的电视电话会议精神，同时，研究对策，布置对有关单位防控非典工作的监督检查。12月29日，市卫生监督所启动了《应急预案》中的6个监督检查小组，对28日制订的检查方案进行了进一步的讨论和补充，并确定了此次监督检查的主要对象是区县CDC和医院发热门诊。
为使本次检查的内容更具针对性，邀请了市CDC的有关专家，就目前形势下区县CDC和医院发热门诊所要开展的工作，从技术上向6个检查小组的全体人员做了介绍，并提出了在检查时应着重检查的几项工作。同时，检查小组人员还与市CDC专家就有关检查内容进行了讨论和沟通。
北京市卫生监督所已向各区县卫生监督所发出通知，要求对辖区内的CDC和一级以上医疗机构防控非典工作再次进行细致的检查，并特别强调防控非典工作决不能流于形式，检查也决不能走过场，要将各项防控措施真正落实到位。