根据当地工作需求，灾区卫生监督人员由5月10日的45人下调至5月16日的41人。其中玉树县、州卫生监督所22人，海东地区卫生监督所10人，省卫生监督所9人。主要工作是对饮用水卫生、食品卫生、餐饮店、集中就餐点、医疗救助点医疗垃圾处理及环境卫生等方面进行卫生监督检查。
　　一、生活饮用水监测：5月10～16日，共采集水样57份（包括自来水5 份、井水31份、泉水20份、瓶装水1份）。共有10水源点/次水源硝酸盐氮超标（显示有人畜粪便污染），其它样品均合格。截至5月16日，累计对78个点的饮用水进行了抽样检测，累计共采水样323份。
　　二、食品卫生监督：5月10～16日，巡查集中供餐点58点次、街头餐饮业点142点次。截至5月16日，累计巡查集中供餐点222点次。
　　三、环境卫生监督：各安置点仍然存在生活垃圾不能及时清运，不能及时消毒，灾民安置点周围及帐篷不能按时有效进行消毒，简易厕所不能及时处理等问题。
　　四、医疗垃圾检查：5月10～16日，巡查了45个医疗点，累计巡查医疗救治点147次。
　　五、卫生安全教育：5月10～16日，在灾民安置点继续采取走村串户、张贴宣传画、发放宣传材料、出动藏汉双语宣传车巡回广播宣传等多种形式开展防病知识宣传活动，健康教育咨询和受教人数21120人次，发放藏文、藏汉文灾后卫生知识等宣传品15562余份。截至5月16日，累计张贴鼠防宣传画2620张，发放鼠防宣传材料16680份，包虫病防治宣传册2900份、《青海玉树震后传染病防控宣传册》2500余册，《地震灾后食品、饮用水、传染病防治知识》18762份，《灾后防病，从我做起》张贴画8000余份，累计受教人数为132900人次。
　　六、灭獭防疫专项工作：第一阶段灭獭工作自4月28日开始，5月15日顺利完成。共组织610人（省内135人，省外15人，解放军及武警官兵460人，投入灭獭3055人次）参加灭獭工作，累计灭獭面积55414.5公顷，堵獭洞数101947个，投药洞数77213个，投药量13850千克。目前灭獭工作整体情况正在评估，以便制定第二阶段灭獭方案。预计近日即可完成评估工作。